Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncapd3Q6ZQK0 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms