Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp34Q6ZQ93 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp34Q6ZQ93 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp34Q6ZQ93 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp34Q6ZQ93 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp34Q6ZQ93 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp34Q6ZQ93 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp34Q6ZQ93 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp34Q6ZQ93 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp34Q6ZQ93 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms