Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot1Q6ZQ08 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms