Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Znf653Q6YND2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Znf653Q6YND2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Znf653Q6YND2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Znf653Q6YND2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Znf653Q6YND2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Znf653Q6YND2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Znf653Q6YND2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Znf653Q6YND2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Znf653Q6YND2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Znf653Q6YND2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Znf653Q6YND2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Znf653Q6YND2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Znf653Q6YND2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Znf653Q6YND2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Znf653Q6YND2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Znf653Q6YND2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Znf653Q6YND2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Znf653Q6YND2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Znf653Q6YND2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Znf653Q6YND2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Znf653Q6YND2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Znf653Q6YND2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Znf653Q6YND2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Znf653Q6YND2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Znf653Q6YND2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Znf653Q6YND2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf653Q6YND2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms