Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc148Q6P5U8 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc148Q6P5U8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms