Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Slx4Q6P1D7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slx4Q6P1D7 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms