Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms