Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt40Q6IFX3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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