Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQV7

Edrf1, Erythroid differentiation-related factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edrf1Q6GQV7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Edrf1Q6GQV7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Edrf1Q6GQV7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Edrf1Q6GQV7 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Edrf1Q6GQV7 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Edrf1Q6GQV7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Edrf1Q6GQV7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Edrf1Q6GQV7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Edrf1Q6GQV7 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Edrf1Q6GQV7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Edrf1Q6GQV7 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Edrf1Q6GQV7 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Edrf1Q6GQV7 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms