Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms