Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep290Q6A078 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cep290Q6A078 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep290Q6A078 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep290Q6A078 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep290Q6A078 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep290Q6A078 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Cep290Q6A078 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cep290Q6A078 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cep290Q6A078 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cep290Q6A078 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cep290Q6A078 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep290Q6A078 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep290Q6A078 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cep290Q6A078 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep290Q6A078 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep290Q6A078 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cep290Q6A078 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep290Q6A078 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Cep290Q6A078 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep290Q6A078 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep290Q6A078 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep290Q6A078 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cep290Q6A078 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cep290Q6A078 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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Cep290Q6A078 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cep290Q6A078 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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Cep290Q6A078 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cep290Q6A078 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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Cep290Q6A078 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
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Cep290Q6A078 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Cep290Q6A078 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Cep290Q6A078 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Cep290Q6A078 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Cep290Q6A078 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cep290Q6A078 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Cep290Q6A078 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cep290Q6A078 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cep290Q6A078 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Cep290Q6A078 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cep290Q6A078 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cep290Q6A078 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cep290Q6A078 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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