Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS6

Sv2c, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, mousemouse

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Length 727 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2cQ69ZS6 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sv2cQ69ZS6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sv2cQ69ZS6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sv2cQ69ZS6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sv2cQ69ZS6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2cQ69ZS6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2cQ69ZS6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2cQ69ZS6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2cQ69ZS6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2cQ69ZS6 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2cQ69ZS6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2cQ69ZS6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2cQ69ZS6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2cQ69ZS6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2cQ69ZS6 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2cQ69ZS6 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2cQ69ZS6 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2cQ69ZS6 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2cQ69ZS6 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2cQ69ZS6 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2cQ69ZS6 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2cQ69ZS6 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2cQ69ZS6 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2cQ69ZS6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2cQ69ZS6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2cQ69ZS6 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2cQ69ZS6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2cQ69ZS6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2cQ69ZS6 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2cQ69ZS6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2cQ69ZS6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2cQ69ZS6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2cQ69ZS6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2cQ69ZS6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2cQ69ZS6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2cQ69ZS6 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2cQ69ZS6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2cQ69ZS6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2cQ69ZS6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sv2cQ69ZS6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sv2cQ69ZS6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sv2cQ69ZS6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sv2cQ69ZS6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sv2cQ69ZS6 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sv2cQ69ZS6 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sv2cQ69ZS6 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sv2cQ69ZS6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sv2cQ69ZS6 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
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Sv2cQ69ZS6 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Sv2cQ69ZS6 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sv2cQ69ZS6 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Sv2cQ69ZS6 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Sv2cQ69ZS6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sv2cQ69ZS6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sv2cQ69ZS6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sv2cQ69ZS6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Sv2cQ69ZS6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms