Protein–RNA interactions for Protein: Q64124

Scx, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScxQ64124 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ScxQ64124 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScxQ64124 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScxQ64124 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
ScxQ64124 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms