Protein–RNA interactions for Protein: Q640N1

Aebp1, Adipocyte enhancer-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aebp1Q640N1 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aebp1Q640N1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Aebp1Q640N1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aebp1Q640N1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aebp1Q640N1 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aebp1Q640N1 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Aebp1Q640N1 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aebp1Q640N1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aebp1Q640N1 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aebp1Q640N1 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms