Protein–RNA interactions for Protein: Q62233

Six3, Homeobox protein SIX3, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six3Q62233 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six3Q62233 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six3Q62233 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six3Q62233 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Six3Q62233 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Six3Q62233 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Six3Q62233 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Six3Q62233 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Six3Q62233 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Six3Q62233 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Six3Q62233 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Six3Q62233 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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