Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim25Q61510 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms