Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ift20Q61025 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ift20Q61025 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ift20Q61025 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ift20Q61025 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms