Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp4Q60972 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms