Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms