Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim38Q5SZ99 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim38Q5SZ99 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim38Q5SZ99 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim38Q5SZ99 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim38Q5SZ99 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Trim38Q5SZ99 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim38Q5SZ99 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim38Q5SZ99 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim38Q5SZ99 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim38Q5SZ99 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Trim38Q5SZ99 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Trim38Q5SZ99 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim38Q5SZ99 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim38Q5SZ99 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim38Q5SZ99 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim38Q5SZ99 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Trim38Q5SZ99 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim38Q5SZ99 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim38Q5SZ99 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Trim38Q5SZ99 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim38Q5SZ99 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Trim38Q5SZ99 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim38Q5SZ99 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Trim38Q5SZ99 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim38Q5SZ99 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Trim38Q5SZ99 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Trim38Q5SZ99 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim38Q5SZ99 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Trim38Q5SZ99 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim38Q5SZ99 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim38Q5SZ99 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim38Q5SZ99 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Trim38Q5SZ99 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim38Q5SZ99 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim38Q5SZ99 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim38Q5SZ99 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim38Q5SZ99 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Trim38Q5SZ99 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Trim38Q5SZ99 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Trim38Q5SZ99 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim38Q5SZ99 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim38Q5SZ99 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Trim38Q5SZ99 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim38Q5SZ99 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim38Q5SZ99 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim38Q5SZ99 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim38Q5SZ99 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim38Q5SZ99 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim38Q5SZ99 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim38Q5SZ99 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim38Q5SZ99 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim38Q5SZ99 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim38Q5SZ99 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim38Q5SZ99 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim38Q5SZ99 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim38Q5SZ99 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim38Q5SZ99 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim38Q5SZ99 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim38Q5SZ99 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim38Q5SZ99 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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