Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spire1Q52KF3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spire1Q52KF3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms