Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox3aQ4TU90 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms