Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ulk4Q3V129 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Ulk4Q3V129 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms