Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms