Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Usp19Q3UJD6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp19Q3UJD6 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms