Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc34Q3UI66 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc34Q3UI66 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms