Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 4930440C22Rik-202ENSMUST00000190754 512 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42723-202ENSMUST00000200561 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Sult3a1-202ENSMUST00000218204 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 AC147628.1-201ENSMUST00000228193 688 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Gtpbp6Q3U6U5 9230110F15Rik-201ENSMUST00000054175 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Sult3a1-201ENSMUST00000092597 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Gtpbp6Q3U6U5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Gtpbp6Q3U6U5 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Gtpbp6Q3U6U5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Gtpbp6Q3U6U5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Gtpbp6Q3U6U5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Gtpbp6Q3U6U5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Gtpbp6Q3U6U5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Gtpbp6Q3U6U5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Gtpbp6Q3U6U5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Gtpbp6Q3U6U5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Gtpbp6Q3U6U5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45701-201ENSMUST00000212049 235 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp6Q3U6U5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms