Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hace1Q3U0D9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms