Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf3c3Q3TMP1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms