Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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