Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbtb38Q3LR78 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zbtb38Q3LR78 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zbtb38Q3LR78 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zbtb38Q3LR78 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zbtb38Q3LR78 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zbtb38Q3LR78 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zbtb38Q3LR78 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zbtb38Q3LR78 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zbtb38Q3LR78 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zbtb38Q3LR78 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zbtb38Q3LR78 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zbtb38Q3LR78 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb38Q3LR78 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb38Q3LR78 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb38Q3LR78 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb38Q3LR78 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb38Q3LR78 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb38Q3LR78 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb38Q3LR78 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb38Q3LR78 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb38Q3LR78 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb38Q3LR78 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb38Q3LR78 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb38Q3LR78 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb38Q3LR78 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb38Q3LR78 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb38Q3LR78 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb38Q3LR78 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbtb38Q3LR78 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms