Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp8Q2V6D6 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms