Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Rpusd3Q14AI6 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
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Rpusd3Q14AI6 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
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Rpusd3Q14AI6 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
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Rpusd3Q14AI6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms