Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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VgfQ0VGU4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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VgfQ0VGU4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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VgfQ0VGU4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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VgfQ0VGU4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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VgfQ0VGU4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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VgfQ0VGU4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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VgfQ0VGU4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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VgfQ0VGU4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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VgfQ0VGU4 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VgfQ0VGU4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
VgfQ0VGU4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
VgfQ0VGU4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
VgfQ0VGU4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
VgfQ0VGU4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
VgfQ0VGU4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VgfQ0VGU4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VgfQ0VGU4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VgfQ0VGU4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VgfQ0VGU4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VgfQ0VGU4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VgfQ0VGU4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VgfQ0VGU4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VgfQ0VGU4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VgfQ0VGU4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VgfQ0VGU4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms