Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ttc39dQ0VF76 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39dQ0VF76 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms