Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd12Q0VE29 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms