Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC23.2■■□□□ 1.31
Lrriq1Q0P5X1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrriq1Q0P5X1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrriq1Q0P5X1 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrriq1Q0P5X1 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrriq1Q0P5X1 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrriq1Q0P5X1 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrriq1Q0P5X1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrriq1Q0P5X1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrriq1Q0P5X1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrriq1Q0P5X1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrriq1Q0P5X1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrriq1Q0P5X1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrriq1Q0P5X1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrriq1Q0P5X1 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.5 ms