Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pate4Q09098 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms