Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
F13bQ07968 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
F13bQ07968 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
F13bQ07968 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
F13bQ07968 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
F13bQ07968 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
F13bQ07968 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
F13bQ07968 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
F13bQ07968 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
F13bQ07968 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
F13bQ07968 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
F13bQ07968 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.35
F13bQ07968 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
F13bQ07968 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
F13bQ07968 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
F13bQ07968 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F13bQ07968 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
F13bQ07968 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F13bQ07968 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F13bQ07968 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms