Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MestQ07646 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MestQ07646 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MestQ07646 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MestQ07646 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MestQ07646 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MestQ07646 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MestQ07646 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MestQ07646 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MestQ07646 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MestQ07646 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MestQ07646 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MestQ07646 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MestQ07646 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
MestQ07646 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MestQ07646 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MestQ07646 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MestQ07646 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MestQ07646 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MestQ07646 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MestQ07646 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MestQ07646 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MestQ07646 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MestQ07646 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MestQ07646 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MestQ07646 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MestQ07646 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MestQ07646 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MestQ07646 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MestQ07646 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MestQ07646 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
MestQ07646 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MestQ07646 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
MestQ07646 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
MestQ07646 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MestQ07646 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MestQ07646 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MestQ07646 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MestQ07646 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MestQ07646 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MestQ07646 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MestQ07646 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
MestQ07646 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MestQ07646 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MestQ07646 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MestQ07646 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MestQ07646 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MestQ07646 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MestQ07646 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MestQ07646 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MestQ07646 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MestQ07646 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MestQ07646 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MestQ07646 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MestQ07646 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
MestQ07646 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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MestQ07646 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MestQ07646 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MestQ07646 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MestQ07646 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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MestQ07646 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MestQ07646 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MestQ07646 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MestQ07646 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MestQ07646 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MestQ07646 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MestQ07646 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MestQ07646 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MestQ07646 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
MestQ07646 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
MestQ07646 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
MestQ07646 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MestQ07646 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MestQ07646 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MestQ07646 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MestQ07646 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MestQ07646 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MestQ07646 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MestQ07646 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MestQ07646 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MestQ07646 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MestQ07646 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MestQ07646 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
MestQ07646 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MestQ07646 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MestQ07646 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MestQ07646 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MestQ07646 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
MestQ07646 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MestQ07646 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
MestQ07646 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MestQ07646 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MestQ07646 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MestQ07646 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MestQ07646 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MestQ07646 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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