Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Caprin2Q05A80 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms