Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top1Q04750 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top1Q04750 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Top1Q04750 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top1Q04750 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top1Q04750 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Top1Q04750 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Top1Q04750 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms