Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nf1Q04690 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms