Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tff2Q03404 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms