Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VcpQ01853 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VcpQ01853 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VcpQ01853 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VcpQ01853 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms