Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga4Q00651 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms