Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcc1P97496 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcc1P97496 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms