Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1bP97358 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms