Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf1P84078 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf1P84078 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf1P84078 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf1P84078 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf1P84078 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf1P84078 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf1P84078 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf1P84078 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf1P84078 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf1P84078 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf1P84078 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf1P84078 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arf1P84078 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms