Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

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Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Gabpb2P81069 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Gabpb2P81069 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabpb2P81069 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms